> 初心者ですが下記のメッセージの権限があるかと言う意味はなんでしょうか？
> このファイルだけが転送できません。
> 
> 553 Directory structure too deep
> < ﾌｫﾙﾀﾞを作成できませんでした。権限があるか、同名のﾌｧｲﾙがないか確かめてください。 >

「ディレクトリの構造が深すぎます」とのことですので、ホスト側の問題のようです。
一度ホストの管理者に問い合わせてみてください。