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> バイナリデータが含まれるファイルは、アスキー（テキスト）モードでは正常に転送できま
> せん。バイナリモードで転送してくださいますようお願いします。

Windows 標準のftpでは OK なのですが、その違いが分りませんが？

Windows ftpがおかしいんでしょうかね？ちゃんと変換していないとか。。。

バイナリーモードで送ると、CR+LF＆漢字の問題がでますね、これでは。
また、CR+LFをLFに変換して、sjisをEUCに変換して、バイナリ転送でもNGです。

NextFTPの仕様ということで諦めます。
（このファイルが特殊なんですね、多分？？）