> 接続した後フォルダの同期を行っても、ホスト側からマウスで操作すると
> 同期がとれますが、ローカル側からはマウスで操作しても同期が行えない。

ローカル側、ホスト側のどちらでカレントフォルダを変更しても、フォルダ
同時変更は行われます。

無駄なフォルダの変更をしないように、片方のフォルダを開くか一つ上に移動した
ときに、もう片方を同期させるかどうかを自動的に判断します。

なお、カレントフォルダの変更コマンドや、コンボボックスからカレントフォルダを
変更したときは、この機能は動作しません。

また、変更先のフォルダがもう片方にない場合は、フォルダ同時変更は行われません。

このあたりを確認してみてください。