> 転送後、簡易ヴュアーでは、ＨＴＭＬタグが表示されているのですが、
> ホームページを開いて見ると反映されておらず、そのページソースをみてると
> その部分のＨＴＭＬタグが消えているのですが、状態がはっきりわかりません。
> なぜ、このような現象が起こるのでしょうか？
> 最近までは、反映されていました。
> アドバイスをお願いします。

お知らせいただいたホームページは特に問題なく正常に表示されているようですが・・・

転送後の簡易ビューアでＨＴＭＬが表示されているのに、実際にホームページを表示すると
消えてしまっているということは、ＦＴＰによる転送は問題なくできています。

ホストまたはブラウザ側の問題か仕様と思われますので、確認してください。