> WinXPとRedHatLinux8.2を使用しています。
> ローカル（SJIS)、ホスト（EUC）に設定してテキストモードでアップロードしているのですが、
> 改行コードがCR+LFの２バイトのままです。
> 以前のバージョンではホストにアップロードした時点で１バイトに変換させることが出来たのですが、
> 今のバージョン3.62ではオプション等にもそのような設定が見当たりません。
> 改行コード変換には対応していないのでしょうか？
> もし故意に非対応にしたのであれば、何か理由があるのですか？

改行コードの変換は、ホスト側のサーバーが行います。クライアント側では、CR+LFで
常にアップロードを行っています。ダウンロード時もサーバーがCR+LFに変換します。

急に改行コードが変換されなくなったのは、ホストのサーバーが変更になったものと
思われますので、サーバーが仕様変更されていないか確認するようにしてください。