> 本ソフトでは、同一フォルダ内であれば複数のファイルのパーミッションを一度に変更できます。
> 任意数のファイルを選択し、属性の変更コマンドで変更してください。
> 
> ファイルの選択にはワイルドカードも使用できます。フォルダメニューから、選択→ワイルドカード
> または、フィルタを使用してください

いえそうではなくて、たとえばcgi-bin以下すべての階層のファイルに対して
ワイルドカードを使用して一括変換といった感じには出来ないかと…
もし出来たら、大量のデータディレクトリを持つCGIも楽にUP出来るんですが。