> Ver2.01β2を使用しています。
> 
> "."で始まるファイルが表示されません。
> あるサーバでは表示されるのですが、本日から使い始めたサーバは
> "."で始まるファイルが表示されません。
> 
> 他のFTPソフトでログインしてみると、表示されましたのでNEXTFTP側の問題と思います。
> 
> 一度、NEXTFTPをアンインストールして再度 インストールしましたが同じ現象が出ます。

ホスト側の隠しファイルは、詳細ファイルリストに表示されていない限り表示できません。

ＵＮＩＸ系ホストでピリオドで始まる隠しファイルを表示したい場合は、ファイルリスト取得
コマンドを「NLST -la」にしてみてください。表示できる場合があります。

これで表示できない場合は、学校や会社のネットワーク管理者にお問い合わせください。