> Windows98でNextFTPを愛用していたんですが、
> WindowsNT にしてから どうも調子が悪い
> みたいなんです。単なるHTMLファイルなんですが、
> アップロードできるものと、できないものが
> でてきたんです。できないファイルはアップロード
> 完了時にプログラムを止めてしまい、再度接続し直さないと
> いけなくて、接続しなおしてからアップロードされた
> ファイルをみるとファイルサイズが０で正常アップできません。
> ちなみに、問題のファイルはWin９８とWin２Kですんなりアップロード
> できました。又、他のFTPソフトでも結果は一緒でした。
> 
> NTだけの設定とかいるんでしょうか？教えてください。

Windows2000は中身はＮＴですから、ＮＴにしたのが問題とは考えにくいです。

どの部分で止まってしまうのか状況がよく分かりませんが、転送開始時に止まる場合は、
ホストの設定の高度な設定のＰＡＳＶモードの設定を切り替えてみてください。

アップロードしたファイルサイズが０になるのは、ホームページの容量を使い切った場合でも
起こります。

その他、状況に合わせてヘルプやホームページのＦＡＱも参考にしてみてください。