複数選択やディレクトリーごとダウンロード時、読み取り権限の無いファイルが
ひとつでも混じっていると、そこでダウンロードを中断してしまう仕様になって
いると思います。

これを、オプションで構いませんから、中断ではなく、無視するようにできません
でしょうか……ベストなのは、上書き確認のようにダイアログが出てくれること
ですが、そこまでは望みません。

この点、ご検討いただけませんでしょうか。