> ホスト側にある異なるフォルダ内の任意のファイルまたはサブフォルダ
> をランダムに選択後、まとめてダウンロードしたいのですがそのような
> 機能はあるのでしょうか。

例えば、フォルダ内の「*.txt」ファイルだけを転送したい場合は、フィルタで「*.txt」を
設定してから転送すれば、そのファイルだけを転送できます。

複数のフォルダにまたがる、全くランダムなファイルをまとめてダウンロードすることはで
きません。