> 使わなくなった画像を,そのまま,サーバーに置いていてもいいのでしょうか？

ホームページ容量に余裕があれば、置きっぱなしでも特に問題はないと思います。

> 消したほうが良いなら、どのようにすれば良いか方法を教えて下さい。

ホームページ転送機能を使用していれば、ローカル側で削除されたファイルは、自動的に
削除します。

手動で削除するには、削除したいファイルを選択後、ツールバーの削除ボタンを押せば
削除できます。