> ＦＴＰサーバ側が EUC漢字コードのフォルダ、ファイル名の仕様の場合、
> コマンドラインからのNextFTPの実行で、シフトJISのファイル名をEUCに変換して
> アップロードする事は可能でしょうか？
> また、コマンドラインからの実行結果をログやステータスなどで
> 別アプリケーションに認識させる方法はないでしょうか？

コマンドラインからのアップロードはサポートしていませんのでご了承ください。
コマンドラインからは、ダウンロードとホームページ転送のみができます。

なお、ログの保存については、次のバージョンで対応します。