> バージョンアップメールやヘルプには記述が無い（と思う）
> のですが、NextFTP の新しいバージョンを取得するのに、
> バージョンアップメールにあるように HTTP(ブラウザ)
> を用いず NextFTP を用いて ftp://ftp.toxsoft.com/pub/
> からダウンロードすることに問題は無いでしょうか？

ダウンロードされるのは、自己解凍のセットアップファイルですので、問題ありません。

新バージョンをセットアップするときは、NextFTPは終了させておいてください。