> はじめまして。
> 二つ程、質問します。
> ローカルのファイルは小文字ですが、転送してから、ｗｗｗのファイルを見ましたら
> 大文字になっていました。普段は問題ないのに。たまに、なります。

WWWフォルダごと、ホームページを転送しているのが原因ではないでしょうか。
小文字のファイル名で転送するオプションがセットされていたり、ローカルの
元のフォルダ名が小文字だと、ホストにも小文字でフォルダが作成されます。

ホストの設定で、ホスト開始フォルダを「WWW」、ローカル開始フォルダをハード
ディスクのホームページフォルダの WWWの中に設定すれば、必ず大文字の WWWの
中に転送できます。

> ホームページ転送機能は、初回のみ、有効なのでしょうか。
> 更新するときは、更新の対象ファイルのみ、
> アップロードの機能を使っておりますが。
> 更新ファイルが沢山あるときは、面倒なので、ホームページ転送機能を使い
> ファイルを一括転送しますが、その時は、上書きしてくれるのでしょうか。
> 昨日、試みましたが、時間がかかりすぎて、中止してしまいました。
> どなたか、初心者の質問に平易にお答えを、上記のメールアドレスに、
> お寄せいただければ幸いです。

これも、上記と同じ原因だと思います。
ホストに転送したフォルダ名が「www」と小文字だったために、「WWW」と大文字に
名前を変更されたのではないでしょうか。
その場合、本来ならば変更ファイルのみを転送するのに、小文字の「www」内に転送
しようとするため、新たにフォルダを作ってすべて転送してしまいます。

「WWW」と「www」の２つのフォルダが出来てしまっていると思います。容量の無駄
ですので、古い方のフォルダを削除して、新しい方のフォルダ名を必要であれば変
更し、上記のホストの設定を行って下さい。