> 現象が分からないので、詳しい内容を教えてもらえませんか。

つまり、ダウンロード、アップロード中に他の操作が行えない。
 
> 転送中に、FTP-新しいウィンドウ（Ctrl+N）で、同じ接続で新しいウィンドウを開
> くことができますので、次のステップも実行できます。

わざわざウィンドウを開かなくても良いようにしてほしい。

少なくとも、FTP Explorerは両方を解決している。