私も、仕事場で、NEXTＦＴＰを使っているのですが、同様の現象
が起こっています。

環境：DELL OptiPlex PentiumPro150MHz
       (自宅で書いておりますので機種名は、ちょっとわかりません)
       メモリ 64MByte
       ＯＳ   NT4.0 Workstation (ServicePack3)
               NT Serverは、稼働していません。

状況：個人アカウントでNEXTFTP使用時にオプション設定を行うと 
        異常終了します。
        administratorの場合、設定できます。
       ただし、個人アカウントでオプション指定を行ってすぐ、ログオ
       フし、administratorでオプション指定を行うと異常終了します。
       再度、オプション設定を行うと実行できます。

NT環境：個人アカウントには、ほとんどライト権を与えておりません
           (個人のワーク以外では、個人のProfileディレクトリ程度)
           administratorでは、基本的にオプション設定可能なため、
          個人アカウントには、ライト権が与えられていないファイ
          ルへライトしようとしているのではないかと思うのですが。
          ちなみに、個人アカウントに対してNEXTFTPインストールデ
          ィレクトリ配下をフルアクセス可能とした場合も状況は、
         変わりませんでした。

※ 私の環境では、以上のような状況になっております。他に必要な
    情報（エラーログ等）がございましたらご指摘ください)

　　解析をよろしくお願いいたします。


P.S. テキスト／バイナリの自動判定（拡張子設定なしで）は、難しい
     のでしょうか？もし可能なら、大変便利になるのですが・・・。