> 1.デフォルトのローカルディレクトリを指定できるようにしてほしい
> 　ダウンロードディレクトリが決まっているのですが、起動直後はい
> 　つもNextFTPのディレクトリになっているので、いちいち移動しない
> 　といけないので面倒です。時々移動するのを忘れたりしますし。

ホストに接続する前にローカルのディレクトリを移動しておけば、次回以降は
そのディレクトリがデフォルトとなります。

NT4.0を使っていて各種設定が保存されないようであれば、最新のバージョン
をダウンロードしてみてください。